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中析检测

细胞RNA-seq检测

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咨询量:  
更新时间:2025-05-10  /
咨询工程师

信息概要

细胞RNA-seq检测是通过高通量测序技术对细胞中转录组进行全面分析的服务,能够揭示基因表达水平、剪接变异体、新转录本及非编码RNA等信息。该检测在基础研究、疾病机制解析、药物开发及精准医疗等领域具有重要价值,可帮助研究者深入理解细胞功能、病理状态及调控网络。

本检测服务涵盖从样本制备、文库构建、测序到数据分析的全流程,确保结果的高灵敏度和准确性。通过标准化操作流程和严格质控体系,为客户提供可靠的转录组数据支持,助力科学发现与转化应用。

检测项目

  • 总RNA质量评估
  • mRNA表达定量分析
  • lncRNA鉴定与表达分析
  • circRNA检测与注释
  • 可变剪接事件分析
  • 差异表达基因筛选
  • 基因融合事件检测
  • SNP/InDel突变分析
  • 功能富集分析(GO/KEGG)
  • 共表达网络构建
  • 转录因子调控预测
  • RNA编辑位点识别
  • 新转录本预测
  • 样本间相关性分析
  • RNA异构体定量
  • miRNA-mRNA互作分析
  • 细胞类型特异性表达解析
  • 时间序列动态表达模式分析
  • 病原微生物RNA检测
  • 单细胞转录组整合分析

检测范围

  • 人类原代细胞
  • 哺乳动物细胞系
  • 植物细胞
  • 干细胞与诱导多能干细胞
  • 免疫细胞亚群
  • 肿瘤细胞
  • 神经细胞
  • 微生物共培养细胞
  • 类器官模型
  • 胚胎发育细胞
  • 血液系统细胞
  • 上皮与间充质细胞
  • 原核生物细胞
  • 病毒感染的宿主细胞
  • 药物处理细胞模型
  • 基因编辑细胞株
  • 衰老细胞模型
  • 应激响应细胞
  • 3D培养细胞
  • 稀有细胞群体

检测方法

  • Illumina双端测序法(高精度短读长测序)
  • Nanopore单分子测序(长读长直接RNA测序)
  • SMART-seq2(全长转录本扩增)
  • Drop-seq(单细胞转录组捕获)
  • Ribo-depletion(去除核糖体RNA)
  • PolyA富集法(真核mRNA特异性捕获)
  • 链特异性文库构建(保留链方向信息)
  • UMI标记(消除PCR重复偏倚)
  • qRT-PCR验证(目标基因表达确认)
  • 生物信息学比对(参考基因组映射)
  • PCA降维分析(样本异质性评估)
  • WGCNA加权共表达网络分析
  • DESeq2差异表达统计模型
  • STAR拼接比对算法
  • Cufflinks转录本组装

检测仪器

  • Illumina NovaSeq 6000
  • Thermo Fisher Ion S5 XL
  • Oxford Nanopore GridION
  • Agilent 4200 TapeStation
  • Qubit 4.0荧光计
  • Bioanalyzer 2100
  • Covaris M220超声破碎仪
  • PCR仪(Veriti Pro)
  • Beckman Coulter Biomek自动化项目合作单位
  • Nanodrop分光光度计
  • 10x Genomics Chromium控制器
  • Miltenyi gentleMACS解离仪
  • Beckman超速离心机
  • Fluidigm C1单细胞制备系统
  • BD FACSAria细胞分选仪

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