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    ITS测序检测

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    咨询量:  
    更新时间:2025-05-11  /
    咨询工程师

    信息概要

    ITS(Internal Transcribed Spacer)测序检测是基于核糖体RNA基因间隔区的高通量测序技术,主要用于微生物(尤其是真菌)的分类鉴定、多样性分析和群落结构研究。该检测可精准解析样本中微生物的种类和丰度,广泛应用于环境监测、食品安全、医药研发及农业病害防控等领域。通过ITS测序检测,用户能够快速识别潜在病原菌、评估微生物生态功能,并为质量控制提供科学依据,是保障生物安全和生态健康的关键技术手段。

    检测项目

    • ITS序列比对分析
    • 真菌物种分类鉴定
    • 微生物多样性指数计算
    • 优势菌群丰度评估
    • 样本间群落结构差异分析
    • 潜在致病真菌筛查
    • 共生微生物互作关系预测
    • 环境适应性基因检测
    • 污染物降解菌株筛选
    • 样本纯度与污染评估
    • 功能基因注释分析
    • 系统发育树构建
    • 稀有物种检测灵敏度测试
    • ITS序列变异位点分析
    • 样本存储稳定性验证
    • 引物特异性验证
    • 跨物种交叉污染检测
    • 序列拼接完整性评估
    • 微生物代谢通路预测
    • ITS序列全长覆盖度评估

    检测范围

    • 环境样本(土壤、水体、空气)
    • 食品及发酵制品
    • 药用植物及中药材
    • 临床组织与体液样本
    • 农业病害植株
    • 工业发酵微生物样本
    • 动物肠道微生物组
    • 化妆品微生物污染样本
    • 海洋与极端环境微生物
    • 实验室培养菌株
    • 污水处理系统生物膜
    • 益生菌制剂
    • 转基因作物微生物组
    • 文化遗产保护微生物样本
    • 昆虫共生微生物
    • 乳制品发酵菌群
    • 生物降解材料微生物群落
    • 病原真菌宿主溯源样本
    • 植物根际微生物组
    • 空气净化系统微生物监测

    检测方法

    • PCR扩增:使用特异性引物扩增ITS区域
    • Sanger测序:单克隆片段双向测序验证
    • 高通量测序:基于Illumina平台的宏基因组测序
    • 荧光定量PCR:靶向物种绝对定量分析
    • 克隆文库构建:低复杂度样本深度分析
    • 生物信息学分析:OTU聚类与注释
    • 三代测序:PacBio平台全长ITS序列解析
    • 变性梯度凝胶电泳(DGGE):快速群落差异检测
    • 荧光标记探针杂交:特定病原菌筛查
    • 纳米孔测序:实时长读长序列捕获
    • 多重PCR:多靶标并行扩增
    • qPCR熔解曲线分析:引物特异性验证
    • 宏转录组测序:活性微生物功能研究
    • 单细胞测序:稀有微生物单细胞分选
    • 芯片杂交技术:快速物种鉴定

    检测仪器

    • Illumina MiSeq测序仪
    • ABI 3730xl DNA测序仪
    • QuantStudio实时定量PCR仪
    • PacBio Sequel三代测序平台
    • Nanopore MinION测序仪
    • Bio-Rad PCR仪
    • Agilent 2100生物分析仪
    • Qubit荧光定量仪
    • Thermo NanoDrop分光光度计
    • Beckman Coulter离心机
    • Eppendorf微量移液器
    • BioTek酶标仪
    • Labconco超净工作台
    • Omni国际标准生物安全柜
    • Illumina NovaSeq 6000高通量测序仪

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